In 2005 is het Programma van Eisen voor het Dokmodel opgesteld en is gestart met de voorbereidingen van de Tracé/MER-procedure*. Ook ProRail heeft een rol in deze procedure. Het kabinet en het college van Burgemeester en Wethouders van Amsterdam hebben in november 2005 groen licht gegeven voor de oprichting van de Zuidas-onderneming. De feitelijke oprichting wordt eind 2007 verwacht. Mr.drs. L.C. Brinkman wordt president commissaris van deze onderneming. In de Zuidas-onderneming werken overheid en marktpartijen samen aan een nieuw hoogwaardig en duurzaam stedelijk centrum. Uitgangspunt daarbij is het Dokmodel.

_{* In de Tracé/MER-procedure wordt onderzocht welke milieueffecten de uitbreiding van de rijksweg, het spoor en vastgoed/stedenbouw hebben op de omgeving. Hierop is inspraak mogelijk. De minister betrekt de Tracé/MER, inspraakreacties en wettelijke adviezen in de besluitvorming en bij de uiteindelijke vaststelling van het tracébesluit voor de weg en het spoor. De gemeente Amsterdam betrekt het hiervoor genoemde in haar bestemmingsplan.}