De gemeenten zijn primair verantwoordelijk voor de NSP. Het gaat in deze projecten immers om het opnieuw inrichten van een deel van het gemeentelijk grondgebied. Omdat de ontwikkeling van de stadscentra rond de HST-stations voor heel Nederland van belang is, ondersteunt het ministerie van Infrastructuur en Milieu deze projecten actief, met name financieel. In opdracht van het ministerie van Infrastructuur en Milieu ontwikkelt ProRail de zes NSP-stations. ProRail is daarbij gedelegeerd opdrachtgever voor het spoorse deel van de stationsprojecten.